由于感染，持续炎症状态，供氧和组织灌注不足是发生MSOF的最常见和最重要的危机因素，应先予以控制和针对处理，如纠正休克，及时处理原发病和外伤，清除坏死组织，引流脓肿，控制腹腔污染等等，都是很重要的措施，妥善处理大伤口的临界生机组织以及隐藏的肠道伤口(包括屏障破坏)，以阻断持续的炎症反应，从而减少白细胞系统的激活，不要滥用广谱抗生素，要注意保持肠腔内正常的细菌菌丛生态学，加强胃的正常杀菌作用，减少细菌及其毒素进入全身，提供充分的能量和合成底物，支持共生的厌氧菌，保持排便通畅，以减少结肠内细菌及其毒素。
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