原发性膀胱输尿管反流的症状主要从两方面表现，肾积水和尿路感染，反流导致上尿路内的尿液无法排空，到一定程度即会产生肾盂和输尿管的扩张，在超声上反映出来，因此凡超声发现的肾积水都应行VCUG，以排除反流，由于相当一部分患儿是无症状反流，在高危人群中，用超声进行反流筛查有实际意义，尿路感染在儿童中更多的表现是非特异性的，包括发热，嗜睡，无力，厌食，恶心，呕吐和生长障碍等。
在婴幼儿无菌反流可表现为肾绞痛，但表现不典型，大儿童可指出在膀胱充盈或排尿时，肋部疼痛，年长儿在并发急性肾盂肾炎时,也有腰，腹部疼痛和触痛， 实时B超检查可作为诊断反流的过筛检查，排尿性膀胱尿道造影(VCUG)是确定膀胱输尿管反流诊断和分级的金标准，凡超声检查发现的肾积水和有泌尿系感染发作的均应进行VCUG，由于小儿对检查的恐惧和不合作，为防止产生假阴性结果，造影时可予镇静剂，适当时要重复进行。
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