(一)发病原因
先天性精囊囊肿根据其发生的来源可分为精囊本身和胚胎期中肾管发育异常形成的两类囊肿，男性胚胎在发育过程中，中肾旁管，中肾管以及存留的一些中肾小管衍变成有用结构或退化无用，它们的某些部分常形成一些管状或泡状残余结构存留在睾丸，附睾或精囊的组织中，有的形成囊肿，有的则在生后的长期生活中，因某些因素引起异常增生形成囊肿，近来文献报告精囊囊肿的发生与常染色体显性遗传的成人多囊肾病(adult polcystic kidney disease,APKD)有关，亦有人(Varney，1954)认为此类囊肿相当于短缩的输尿管或认为是残留的输尿管芽发展成的一囊肿样憩室，故有人称之为“假性精囊囊肿”。
(二)发病机制
囊肿多为单发，大小不等，最大者容量数千毫升，有报道达5000ml者，国内国鸿钧报告1例囊液达2500ml，有些病例射精管狭窄或闭塞，可并发感染，结石等，国内报道合并结石7例，1例多达157枚，结石多为磷酸钙盐内含果糖成分，王树森等利用能谱仪分析一例精囊结石，见各层化学成分均为水草酸钙石，实为罕见，镜检囊肿壁为胶原结缔组织，内衬一层立方上皮，可见炎性反应，巨大精囊囊肿可造成输尿管梗阻。
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