感染（35%）：
大肠埃希杆菌于1885年德国科学家Es-cherich发现，属肠杆菌科，埃希杆菌属，革兰染色阴性，兼性厌氧，菌体大小为(1.0～1.5)μm×(2.0～6.0)μm，无荚膜，多数菌株有鞭毛，4～6根，为周鞭毛，不生芽孢，可分解葡萄糖和其他糖类，使其发酵产酸和产气，硝酸盐还原试验阳性，氧化酶阴性，产生吲哚，不利用枸橼酸，营养要求低，在普通培养基上生长良好，最适生长温度为37℃，在42～44℃仍能生长，该菌为肠道正常菌群，人和动物粪便中大量存在，广泛分布于自然界，含质粒编码抗生素抗性，大肠毒素，肠毒素，菌毛等，表面有O，H，K抗原，目前已发现药物和其他菌群的抑制，自20世纪80年代后大肠埃希杆菌产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的比例迅速增加，国外报道ESBLs的产生率2.2%～28%，国内为5%～32.4%。
机体免疫防御功能下降（30%）：
大肠埃希杆菌为条件致病菌，发病原因为机体免疫防御功能下降，吸入口咽部定植菌或由腹部脏器如胃肠道和泌尿生殖道感染，通过血行传播等，主要发生于老年衰弱患者，原有各种慢性基础疾病，危重病患者，气管插管，长期使用皮质激素及其他免疫抑制药治疗者，长期使用抗生素而致菌群失调者，以及各种免疫球蛋白缺陷患者等，为本病的易感人群，在教学医院等综合性医院中，病人粪，尿和口咽部分泌物等标本中携带的含多重耐药基因的大肠埃希杆菌的传播，给治疗带来困难。
病理（25%）：
大肠埃希杆菌肺炎的病理与其他革兰阴性菌肺炎相似，主要呈现肺下叶的支气管肺炎改变，以两侧病变多见，病程6天以上者常有肺小脓肿，胸腔积液甚至脓胸改变，炎症累及气管-支气管黏膜较少，可能因为多数大肠埃希杆菌肺炎为血源性途径所致，肺泡内有浆液和中等量的单核细胞填充，病程早期红细胞渗出多见，后期可见中性粒细胞，巨噬细胞，可有肺泡壁增厚，可见坏死病变，部分病例可伴有大肠埃希杆菌引起的胆囊炎，肾盂肾炎或脑膜炎等病变。
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