支气管源性囊肿较小时，可无任何临床表现;当囊肿增大或合并感染时，可对周围组织产生压迫症状或出现感染症状。
支气管源性囊肿发生在肺内时，压迫支气管和周围肺组织，出现喘鸣、咳嗽;合并感染时，出现咳嗽、咳痰、低热、偶尔少量咯血等。当囊肿位于纵隔时，表现为胸痛、胸闷;压迫气管、食管或血管时，表现为呼吸困难、咳嗽、吞咽梗阻、大血管受压综合征等。异位支气管囊肿依发生部位不同，可无临床症状或因囊肿增大、囊腔感染出血而表现相应的症状;罕见囊肿位于皮下时，偶可通过窦道向皮肤外引流黏液。
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