粪便镜检白细胞0～3/HP，细菌培养无致病菌，病原学诊断最初通过电镜，免疫电镜从十二指肠引流液及粪便中直接看到轮状病毒颗粒获诊断，但不适于临床常规应用，目前多采用免疫学或核酸方法来检测粪便中抗原，一般4h即可出结果，国内以酶联免疫吸附试验(ELISA)及提取粪便中病毒RNA，作核酸凝胶电泳(PAGE)开展较普遍，轮状病毒PAGE可见11条RNA片段，集成4组，各含4-2-3-2条片段为其特征，又可根据其最后二片段相距远近，分为长，短两型，目前已开展斑点杂交，寡核苷酸及聚合酶链反应(PCR)等方法检测A属轮状病毒外层衣壳的VP7蛋白分子来诊断轮状病毒感染及其血清分型。
此法特异性强，敏感性高，但仅能在一些科研单位进行，近年轮状病毒组织培养，亦已在经胰蛋白酶处理的Mal04细胞株上获得成功， 一般不须做特殊辅助检查，必要时做胸片和心电图检查，以明确肺部有无病变，有电解质紊乱如低钾血症时，心电图检查 S-T段降低，T波低平，双相，最后倒置,出现u波并渐增高，常超过同导联的T波，或T波与u波相连呈驼峰样。
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