HHV-6是一种包膜病毒，并有20面体核衣壳，包裹着线状ds-DNA，HHV-6基因组与其他类型疱疹病毒之间有一定的同源性，但在血清学上却有差异，HHV-6感染遍及世界各地，如同其他疱疹病毒，人在幼年早期即已获得原发感染，成人则普遍感染。
病毒经唾液，气管分泌物及尿液排出，幼儿通过与父母密切接触而感染，在2岁时，HHV-6抗体检出率可达90%或更高，至30～40岁时则有所下降，40岁以上的成人中仅60%有HHV-6抗体。
因原发感染而发病时，患儿出现急性发热性玫瑰疹，此后，病毒在体内进入潜伏感染状态，其基因组合以整合形式存在外周血淋巴细胞染色体，在机体免疫低下时，潜伏的病毒被活化，病毒如何进入潜伏状态及被激活的机制尚不清楚，HHV-6主要感染CD4 T细胞，并上调CD4+T细胞表达，此外，HHV-6亦可感染CD8+T细胞，NK细胞，巨噬细胞，大单核细胞等，从而破坏机体的抗病毒细胞免疫。
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