由于异位肾血管的高发率以及输尿管中一根或二根呈拱形围绕或跨过肾块所致，融合肾易发生输尿管梗阻，因此，肾积水，结石和感染也就多见，占据骶骨凹面的巨大融合肾还可引起难产。
(1)感染，主要表现为双球菌性肺炎、腹膜炎、皮下感染、泌尿系感染等。感染起病多隐匿。
(2)血栓及栓塞性合并症，此为本病严重致死性合并症之一。其次是肺动脉或静脉栓塞，周围静脉发生血栓性静脉炎。
(3)促发心血管疾病，由于长期高脂血症，尤其是低密度脂蛋白血浆浓度升高，可加速动脉硬化。近年又发现其可加重肾小球进行性硬化。
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