男生殖系结核的临床表现往往是附睾结核的病象，病情发展缓慢，症状轻微，附睾部逐渐肿大，偶有下坠或轻微隐痛，可不引起病人的注意，因此常在无意中发现，附睾病变从尾部向体部，头部蔓延而至整个附睾，病变发展时可与阴囊粘连并干酪样坏死形成冷性脓肿，最后溃破成窦道，经久不愈，少数附睾结核病例可有急性症状，是为继发性感染所致，病人有突然发热，阴囊部附睾处红肿疼痛形成脓肿溃破，急性症状逐渐消退后又转入慢性阶段，输精管结核的表现仅仅是纤维化后增粗，变硬，呈索状或串珠状，双侧输精管，附睾结核患者可引起不育症。
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