HIV感染（30%）：
HIV是一种杀细胞病毒，属反转录病毒科，慢病毒属，灵长类免疫缺陷亚属，HIV的核酸可与宿主感染细胞的DNA整合，使HIV不易从体内消除，HIV能够与细胞表面的CD4分子结合，在CCR5，CXCR4等协同受体的作用下，与宿主细胞发生黏附，融合，穿入宿主细胞膜内。
病理（30%）：
病毒的易感细胞包括T辅助细胞，单核细胞，巨嗜细胞，神经胶质细胞等，HIV侵入辅助性T淋巴细胞后，进行反转录，将病毒基因整合到宿主细胞染色体上，通过转录，翻译，复制出大量病毒，使细胞破坏，辅助性T淋巴细胞是人体内重要的免疫细胞，HIV辅助T细胞和其他免疫细胞的破坏，可严重削弱机体对外来抗原的免疫应答，破坏对病毒，分枝杆菌，真菌感染的保护作用以及对肿瘤抗原的免疫监督作用，导致免疫功能逐渐衰竭，因而AIDS患者易患顽固性机会感染和肿瘤，AIDS消化道的损伤。
免疫功能缺陷（30%）：
主要与胃肠道免疫功能缺陷有关，临床上表现为各种病原体的感染，如原虫，病毒，细菌，真菌及非典型结核杆菌的感染，也可发生各种肿瘤，如卡波西肉瘤(Kaposi sarcoma，KS)，淋巴瘤等。
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