颈动脉血栓内膜切除治疗后可能并发脑梗死以及脑出血，心肌梗死，伤口出血或感染，脑神经损伤等，术后也可能出现颈动脉再狭窄，血管内支架成形术可能并发脑栓塞，夹层动脉瘤，再狭窄，穿刺部位血肿和假性动脉瘤等。
短暂性脑缺血发作是由于负责供应脑部血液的动脉血管短时间医学上称“一过性”供血不足，引起相应动脉负责供血的脑组织发生暂时性功能障碍。其常见的并发症有常有半侧手足无力、偏瘫、单眼突然黑朦或失明、失语等，常伴有高血压、动脉粥样硬化或糖尿病、心脏病、颈椎病。
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