本病属自限性疾病，在其病程过程中，随着免疫机制的建立，很快即可自愈。因此治疗的重点在于减轻症状，防止角膜并发病的发生。
1.抗病毒药物
目前对腺病毒尚无特效药物。常用的药物有：
(1)吗啉双呱(ABOB)：采用10%～15%溶液及眼膏4～10次/d滴眼。必要时配合口服治疗。成人1.2～1.5g/d，小儿0.8g/d，分3次口服。ABOB一般无特殊副作用，高浓度溶液滴眼使用次数过多时，可发生多发性上皮糜烂。
(2)碘苷(IDU)：0.1%IDU溶液或0.25%眼膏，4～8次/d点眼。
(3)1.25%聚维酮(PVP)溶液或0.5%眼膏，4～8次/d点眼。
以上抗病毒药物的治疗效果尚不能肯定，既不能缩短结膜炎的病程，也不能减少或防止上皮下浸润的发生。
2.抗生素药物
局部滴抗生素眼液对本病无治疗效果，主要是预防混合细菌感染，常用的药物有庆大霉素、卡那霉素溶液或眼膏，应尽量不用混悬液，以减少局部刺激。
3.血管收缩药物
充血较重时可采用0.1%肾上腺素(epinephrine)用生理盐水稀释20倍滴眼，可使眼部充血减轻，症状好转。一般不宜使用过久，以3～5次/d滴眼，持续1周为度。
4.糖皮质激素
(1)结膜炎：在结膜炎期，如病人有严重的结膜反应并伴有假膜形成，或有早期睑球粘连，局部应用可减轻症状，同时可预防或减轻角膜病变的发生。常用的药物有0.1%氟米龙(FML)和0.02%地塞米松溶液，4～6次/d滴眼，晚上用可的松眼膏1次，一般以持续使用2周为度。
(2)角膜炎：2周后当结膜炎症消退，而未出现角膜炎者应立即停止使用。若上皮下浸润时应再继续使用，病情较轻者(10余个浸润灶)可采用0.05%氟米龙或0.02%地塞米松4～6次/d滴眼;较重者(10个浸润灶以上)可用0.1%氟米龙或0.05%～0.1%地塞米松6～8次/d滴眼，必要时联合结膜下注射地塞米松2mg，每天或隔天1次;待浸润灶迅速减少或明显好转，再逐渐减少滴眼次数或降低滴眼溶液的浓度进行维持治疗，切勿立即停药、以防复发。对于位于瞳孔区或对视力影响不大的上皮下浸润，最好不要采用糖皮质激素滴眼治疗。
(温馨提示：以上资料仅提供参考，具体情况请向医生详细咨询。)
