对于宫颈湿疣的治疗一般应采用局部破坏性治疗，如激光、冷冻、电凝等。妊娠合并宫颈湿疣时宜在孕34周前进行局部治疗，以免分娩时发生宫颈裂伤等并发症，若妊娠足月合并较大的宫颈湿疣宜行剖宫产术。
1、冷冻疗法
是一种皮肤科常用的治疗方法，它是以液氮或二氧化碳干冰冷冻皮肤病损，使皮肤损害局部水肿、坏死，以达到治疗的目的。尖锐湿疣是由于尖锐湿疣病毒的感染，导致皮肤粘膜的良性增生。它有大量的小血管，增殖迅速。用冷冻的方法可使尖锐湿疣内结冰，形成组织局部的高度水肿，从而破坏疣体。冷冻治疗的最大好处是局部不留痕迹，治愈率约70%左右。可用喷雾法或直接接触法，适用于平坦较小的疣体。一般每周冷冻1次，连续2～3次。
2、激光治疗
是皮肤性病科常用的治疗尖锐湿疣的方法。它的特点是见效快，在治疗的当时，疣体即可脱落。常用的是二氧化碳激光，烧灼疣体，一般1次即可使疣体脱落。但是，由于激光的光束过于集中的原故，激光治疗只适用于疣体不太大的尖锐湿疣，如疣体较大，激光治疗很容易复发。
3、微波治疗
是进入90年代后兴起的治疗方法。它的原理是利用微波的高频震动，使疣体内部水分蒸发，坏死脱落。微波治疗的特点是，疣体破坏彻底，不易复发，但创面恢复较慢，容易继发感染。所以微波治疗特别适用于治疗疣体较大的，孤立、散在的，同时要远离包皮系带的尖锐湿疣，以防损伤包皮系带，影响男性的性功能。
4、电烧灼
是较老的一种治疗方法。过去皮肤科医师常用高频电刀或电烙铁烧灼寻常疣、色素痣及其他皮肤赘生物。它的特点是操作简单，见效快。高频电刀能直接切除和干燥疣体，治疗也较彻底，但是，电烧灼疮面愈合较缓慢。综上所述，电烧灼治疗，可用于任何尖锐湿疣的治疗，但是对施术者的技术要求较高，烧灼太过或不足都是有害的。同时要注意无菌操作，预防感染。
5、手术治疗
尖锐湿疣一般不主张手术切除，因为手术治疗后，尖锐湿疣很容易复发，使治疗失败。但对带蒂的较大的疣体可考虑手术切除。有的患者尖锐湿疣生长过于迅速，或大如菜花，其他治疗十分困难，可考虑手术治疗。为防止复发，术后配合其他治疗。
6、光动力治疗
氨基酮戊酸光动力疗法(ALA-PTD)：ALA-PDT是利用血红蛋白合成中ALA经过一系列酶促反应后产生原卟啉(Pp)等光敏物质的原理，给于大量外源性ALA，肿瘤细胞或生长旺盛的细胞选择性吸收ALA，并在细胞中转化为内源性Pp，后者在特定波长红光照射下，使细胞产生活性单肽氧，从而杀伤肿瘤细胞或生长旺盛的细胞，而对正常细胞无影响。疣体清除率为95%，总复发率为5%，疗效明确，患者耐受性好。国外亦有多位研究者采用局部ALA-PDT治疗生殖器CA患者，取得了满意的效果，对周围皮肤粘膜无影响，证明ALA-PDT可以选择性地杀伤CA的表皮细胞，最终达到去除疣体的目的，同时预防宫颈癌的发生。
宫颈湿疣的药物治疗方法可采用宫颈处用尾纱的方法上药：将消毒纱布叠成一厘米见方的小方块(大约20-30层纱布)，用线系好，线要留10厘米长左右，上药时留在阴道外，每次将药液20-30滴滴到纱布块上放入阴道内(一定要让纱布块接近患处)，4小时后取出，每日一次，连续使用3天。停药。先用A三天，休息5、6天后再用B三天，待一周后复查。值得注意的是：任何一种治疗方法都应在专业医生的指导下进行，且不可自行盲目用药，以免发生意外。
对于上述治疗无效或反复复发患者，临床上多采取中医中药治疗。从多年的临床验证看来，中医中药对于久治不愈及反复复发者收效甚好，治愈率高。
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